Ongeveer een jaar geleden kondigde Kuipers verdere bezuinigingen aan in de zorg. Hij wilde het huidige aantal afdelingen van kinderhartchirurgie gaan halveren. Van de vier centra in Leiden, Utrecht, Rotterdam en Groningen mochten er nog maar twee openblijven.

Maar tot ieders verbazing besloot Kuipers om de afdeling in het Rotterdamse Erasmus MC open te houden. Dit zou betekenen dat de ervaren Cahal in Leiden, met 26 jaar ervaring, zijn deuren moest gaan sluiten. Het Leidense UMC kon zelfs zijn status van academisch ziekenhuis gaan verliezen.

Betrokkenen vonden Kuipers' onderbouwing 'onzorgvuldig, onvolledig en onjuist'. Leiden moest gaan sluiten, om Rotterdam open te houden: een ziekenhuis waarvan Kuipers zelf jarenlang bestuursvoorzitter is geweest. De minister negeerde een advies van de Nederlandse Zorgautoriteit en volhardde in zijn keuze. Al snel vermoedde PVV-Kamerlid Fleur Agema dat er sprake was van belangenverstrengeling. 

Rechter stelt ziekenhuizen in gelijk
Leiden en Utrecht waren woest, en startten een rechtszaak tegen het VWS-ministerie. Nu heeft de rechter in hun voordeel beslist, meldt NOS. Volgens de rechter maakte Kuipers een "verregaande keuze" die "diep en onomkeerbaar ingrijpt in de organisatie van hartchirurgie voor kinderen met een aangeboren hartafwijking".

De bestuursvoorzitters in Leiden en Utrecht zijn opgelucht na het vonnis. Ze noemen de uitspraak "goed nieuws voor de kwaliteit en toegankelijkheid van academische hart- en kinderzorg, voor de toekomst van kostbare kinder-ic-capaciteit in Nederland en van aanpalende zorg, zoals voor kinderen met kanker". 

Maar zelf hoeft Kuipers geen verantwoordelijkheid meer te dragen voor het rechterlijke vonnis. Hij is één dag voor de uitspraak per direct opgestapt als minister. Het is onduidelijk of hij vervroegd is vertrokken vanwege de rechtszaak. Hoe dan ook zal de D66'er binnenkort gaan beginnen aan een baan in het buitenland.